На протяжении многих десятилетий полуостров с большим количеством военных объектов и разнообразным природным ландшафтом был закрытой для посещения зоной. В результате ценная природа на Пальяссааре сохранилась в относительно нетронутом виде, здесь образовался уникальный орнитологический заповедник. Сегодня Пальяссааре представляет собой полуостров с береговой линией протяженностью 6,8 км, хотя еще сотню лет назад на месте полуострова Пальяссааре было два небольших острова. В 2005 году был создан заповедник Пальяссааре, представляющий собой орнитологический заказник общеевропейского значения, где зарегистрировано 233 вида птиц, из них 85 охраняемых видов. Орнитологическое разнообразие обусловлено мозаичным ландшафтом (тростник, луга, кустарники, морское мелководье) с хорошими условиями для отдыха и пропитания птиц, а также расположением на пути пролетной траектории птиц – т. н. Западно-Таллиннского миграционного маршрута. Отсюда отправляются в путь стаи как воробьиных, зуйков, так и хищных птиц. Разнообразный ландшафт представляет собой отличное место обитания для лисиц и зайцев-русаков. Кроме того, здесь множество подходящих мест обитания для стрекоз, которых на Пальяссааре насчитывается 16 видов. Видовое разнообразие дневных бабочек тоже всегда впечатляет своей многочисленностью (33 вида). Из охраняемых видов на Пальяссааре обитает такая дневная бабочка, как червонец непарный. Территория заповедника пронизана множеством пеших троп, кроме того здесь возвышаются две смотровые вышки. С Екатерининского причала длиной 300 метров открывается один из самых романтичных видов на город Таллинн. Расположенный здесь пляж Пикакари уже не раз удостаивался почетного знака экологического качества «Голубой флаг».
