Laulaa pajun oksalla tai kaislikossa, tekee usein kesken laulun lyhyen ja väreilevän laululennon. Ruokokerttunen liikkuu hyvin elävänä ja varovaisena lintuna piilossa taitavasti matalassa pensaikossa ja ruohikossa.
Pesii tiheässä katajajapenssaassa, usein myös ruovikossa tai pensaita kasvavilla soilla, myös umpeen kasvaneiden ojien ja järvien rannoilla, tulvaniityillä, pajukoissa jne. Ruokokerttunen rakentaa pesän yleensä veden lähelle. Pesä on niin hyvin kätketty, että sitä on jopa poikasten ruokkimisen aikana vaikea löytää.
Ruokokerttunen on hyvin hyödyllinen lintu. Hyönteisiä hävittämällä se auttaa ylläpitämään vesistöjen rannalla kasvavien pensaiden ja ruovikkojen luonnollisesta tasapainoa.
