Jopa Pääskülan rämeessä on jälkiä Pietari Suuren merilinnoitukseen liittyvistä rakennustöistä, kun rämeen halki rakennettiin 1913–1918 itä-länsisuuntainen patotie. Patotie yhdisti idässä Männikun ammusvarastot rämeen länsireunalla sijaitsevaan linnoitukseen. 1900-luvun alkupuolella rämettä kuivattiin turveteollisuutta varten, joka käsitti noin 10 hehtaaria rämeen luoteisnurkasta.
Turpeen kaivaminen lopetettiin 1950-luvulla, minkä jälkeen sinne alettiin viedä jätettä. Pääskülän virallinen kaatopaikka avattiin vuonna 1974. Jätteiden kuljetus lopetettiin vuonna 2003 ja kaatopaikka suljettiin lopullisesti vuonna 2007.
Vuonna 2002 Pääskülan rämeellä oli suuri tulipalo, jonka jäljet ovat edelleen nähtävissä. Viheralueen koon ja suuren luonnon monimuotoisuuden vuoksi Pääskülan rämeelle perustettiin suojelualue vuonna 2013.