Площадь созданного в 1957 году заповедника составляет 703 гектара, и охватывает долину реки Пирита, речные террасы, обнажения и всевозможные растительные сообщества. На террасах древней долины реки возвышаются сосняки, которым насчитывается не менее 150–200 лет. На территории ландшафтного заповедника располагается также бывшее болото Клоостриметса площадью примерно 20 гектаров. В настоящее время в результате деятельности человека болото превратилось в черничный перегнойно-болотный сосняк. Заповедная зона – важный коридор для передвижения млекопитающих. Значительное видовое разнообразие обусловлено многообразием мест произрастания. На территории заповедника произрастает порядка 650 видов растений, а также насчитывается свыше 120 видов птиц. Здесь произрастают многие виды растений, находящиеся под охраной природы: армерия приморская,
прострел луговой, пальчатокоренник балтийский, гудайера ползучая, дремлик широколистый и др. Кроме того, территория является важным местом поиска пропитания для летучих мышей в летний сезон. Долина реки Пирита типична для Северной Эстонии. Низовье реки характеризуется глубиной, большим уклоном, низким руслом со множеством валунов, узкой поймой и террасами на склонах долины. На левом берегу реки находится обнажение Люкати, верхняя часть которого состоит из песчаника, а нижняя – преимущественно из глины. В ландшафтном заповеднике речной долины Пирита находятся Таллиннский ботанический сад и городище Иру. Расположенное неподалеку кладбище Метсакальмисту является местом упокоения многих выдающихся деятелей Эстонии. Среди известных лиц здесь похоронены Эдуард Вильде, Константин Пятс, Лидия Койдула, Антон-Хансен Таммсааре, Пауль Керес, Раймонд Валгре и Георг Отс.
