Kukkii toukokuussa ja kesäkuussa. Kukinnot ovat violettejä ja niissä on 9-30 kukkaa, jotka ovat melkein tuoksuttomia. Kasvilla on pyöreä, teräväkärkinen mukula.
Miehenkämmekkä on Virossa II kategorian rauhoitettu laji. Pääasiallisia uhkia ovat kasvupaikkojen vesakoituminen ja muulla tavalla tuhoutuminen. Villisiat pitävät mukuloista.