Спина зелёной пеночки блеклая оливково-зелёная, брюшко серо-белое. На крыле узкая и относительно короткая полоса. Над глазами тянется отчетливо заметная длинная светлая полоска, на высоте глаз – темная глазная плоска. Клюв темный, довольно острый и короткий. И самец, и самка выглядят похоже. Зелёная пеночка обитает на склонах и в долинах рек, где растут высокие деревья. В основном держится на верхушках высоких деревьев. Пение торопливое и ритмичное, немного напоминает пение крапивника. В Эстонии эта гнездящаяся птица распространена местами. Обычно строит гнёзда в ямках на земле, в полостях под камнями, между камнями и кочками и в т. п. укрытиях. Обустройством гнезда занимается только самка. Гнездо строится из тонких сухих травинок, мха и волоса.