Ääntelee yleensä harvoin ja on erakkomainen. Saaliin huomatessaan syöksyy sen kimppuun ja nappaa taitavasti ilmasta tai maanpinnalta. Vaanii ruohossa liikkuvaa saalista kuin haukka, pysyen nopeasti siipiä liikuttaen yhdessä paikassa.
Ravintona ovat suuret hyönteiset (sudenkorennot, heinäsirkat, kuoriaiset ja kimalaiset), mutta myös pienet jyrsijät ja linnut. Linnut hankkivat ruokavaraston, jonka ne keräävät teräviin oksastoihin, oksiin tai piikkilankaan.
Pikkulepinkäinen lähtee muuttomatkalle elokuun lopussa. Muutto tapahtuu öisin ja yksin. rauhoitettu laji (III suojelukategoria virolainen luokitus).