Väike-kärbsenäpp on ümara pea ja valgete külgedega musta sabaga lind. Suvel on isaslinnul pea hall ja kurgualune varieeruvalt kahkjasroostepunane. Teised sulestikud on tuhmimad, ülalpool pruun, alapool kollakasvalge, õrna aprikoositooniga rinnal.
Väike-kärbsenäpp jälitab putukaid varitsuskohalt tõustes, lendab vilkalt läbi lehestiku, jõnksutab tiibu ja saba. Peatumisel nõksutab tihti saba ja kehitab tiibu. Pesa ehitab emaslind üksi. Ta ehitab selle sobivasse puuõõnsusesse või tüveharude vahele. Pesamaterjalina kasutab ta põhiliselt rohelist sammalt, aga ka kuivi puulehti, kõrsi ja taimevilla. Kuulub looduskaitse alla (III kaitsekategooria).